在美国免疫年会上的演讲视频（百度云盘分享）
前几天把在美国免疫年会上演讲的视频放在网上了，可是许多国内的朋友没法“翻墙”去看或者下载。最近回国把视频分段放在百度云盘上，便于大家观看分享：（1）为什么要用二代测序做免疫组？（2）如何做免疫组测序？（3）如何使用免疫组数据？免疫组多样性指数免疫组变化指数免疫组共享指数（4）多重PCR技术使得免疫组测序成为可能（5）全自动为二代测序建库避免扩增产物污染（6）免费软件分析高通量测序结果（7）R10K国...
View Article做到不后悔，你就幸福了。
后悔，似乎也是新常态：股票买晚了，或者卖早了；房子买晚了；学科选错了；海归回晚了；测序仪买错了；老公选错了。。。前两天和国内的一个大型临床诊断公司的老总聊，说到当初二代测序无创产前诊断市场刚刚兴起的时候本来想上，但是怕国家相关政策还没有出台，上了被枪打出头鸟。可是后来申报的时候，国家说你没有经验，所以就不批。真是，因为没有违法的经历，连合法经营的机会也失去了。现在很后悔，当初没有冒风险上。我以前写 ...
View Article在台湾住院
陪太太来台湾度假，参加一个晚辈的婚礼。昨天突然发热，发现下肢腹股沟处有红肿痛并线状蔓延。我疑是蜂窝组织炎金葡感染，晚上十点看急诊。几分钟内挂好号（没有健保卡，自费），医生也在十几分钟内问诊，取血验常规（白细胞分类，没有做血培养），半小时内在急诊室打上点滴，抗菌素（头孢类）就用上了，体温从38.8C一小时内降至38度，下半夜体温变正常。现在还在住院观察，下午再静脉给药后应该可以出院了。我读医学院唯一一...
View Article我那位姓谷的老哥
网上疯传谷歌正在和政府商谈重新登陆。以科学工作者的角度看，谷歌回归愈快愈好。最近几次回国，呆得时间稍微久些，才觉得没有谷歌极不方便，我的科研比别人更依赖谷歌，所以我最近对谷歌的搜索引擎做了系统了解，因为我做免疫组信息分析和搜索引擎有异曲同工之处：（1）网上有几十亿网页；人有至少几万亿不同的T细胞受体。（2）搜索是关键词输入后，相关网页马上跳出来；免疫组分析的目的是一份标本的数据下去（相当于一个关键词...
View Article互联网+生物技术，怎么加？
在李克强总理的号召下，国内正在兴起“互联网+”的新一轮创新运动。那么，在生物技医疗术领域，怎么把互联网加上去？我觉得，“互联网+”是一个非常好的概念，但是不能机械性地硬把互联网加到一个什么领域上，加，要加到点子上，真正产生效益。我最近在读ChrisAnderson写的《长尾》一书，这是理解互联网经济模式之精髓的一本好书：作者发现，互联网出现以前的经营模式都是所谓的“短头”模式：无论是电影，唱片，还是...
View Article减少医闹：请把这个挂在医院
医学院同学的圈子里经常有各地恶性医闹事件的报道，和美国的枪击案一样，一旦发生大家愤怒，过后就麻木了。我给大家出个主意，把下面这个内容贴在医院大厅，让病人清楚医院不是修车行：医院不能保修病人，原因不是医生不努力。首先，病人的毛病不像修车那么容易，没有完整的知识（零部件图纸），个体误差大，病人自己平时不注意保养，诊断病因很难，对症下药更难。有本事，找厂家去闹！厂家到底是谁？上帝如果那么神通广大，为什么 ...
View Article论文发表在eLife上，免疫组测序会议结束
一直忙着开发技术，专利写了一大堆，论文发表得有限。最近我们斯坦福的合作者发表了一篇重要文章：该研究把高精度流式细胞仪技术和高通量免疫组测序技术结合研究B淋巴细胞的发育。结果表明B细胞还可以细分，具有不同的生理和病理功能。文章发表在比较新的开源杂志elife上。这个杂志很有特色，2012年创办，头一年的影响因子就8点多，第二年就9点多。杂志声称不追求影响因子，采取一个全新的机制：编辑不是“专业编辑”而...
View Article研发诊断的创新宝典
最近脑子里一直想着（分子）诊断试剂研发的问题，关于这个题目我以前也写过不少博客文章（见下面链接），可是我总觉得还没有想透彻，也没有谈痛快。诊断，应该是个很简单的概念：诊断，就是在标本中找到病人特有的信号。标本，可以是血液，尿液等“无创”取材得来的；也可以是通过手术活检得来的。病人特有的信号，就是那些和疾病密切相关的病理变化。这个变化是病人独特的，与非病人（包括正常人和患有其它疾病的病人）有本质不同 ...
View Article摄影艺术与诊断科学
科学要严谨，艺术要奔放，两者本不相融，可是常常有密切相关。最近分析免疫组测序数据，脑子里整天想的都是如何提高诊断信号，如何降低背景。突然发现，这些信噪比的调节和摄影很相似：把光圈放大，曝光时间长些，收集到的信号就多，可是背景噪音也会跟进来。如何调整光圈，快门，ISO来得到最好的照片？这是著名的曝光三角关系：首先是胶片的感光度（ISO),是相机（胶片）对光线的敏感度；光圈，决定收入光线的量；快门，控制...
View Article孙子兵法为什么没提到恐怖主义战略？
又在路上，应邀去欧洲讲课，先去英国FrancisCrick研究院，然后去法国巴斯德研究院的等。在巴黎恐怖主义袭击后不久去那里，不能不思考有关问题。因为做免疫组测序工作，也经常翻翻孙子兵法找灵感，所以才想到这个话题。孙子兵法可以说是兵家必读的书了，可是为什么里面没有直接提到恐怖主义战略？我想可能有如下原因：（1）古时候还没有电视。（2）古代中国没有死后进天堂的宗教文化。（3）那时武器杀伤力差。（4）孙...
View Article一个给高校赚钱最多的专利：$5.5亿美金
上周应邀去斯坦福大学参加一个特殊活动：斯坦福大学遗传系的Herzenberg实验室得到一笔捐款，建立了一个“流式细胞仪”冠名教授Chair,并由LeeHerzenberg首任该荣誉。为此还专门组织了酒会和学术研讨会：这是研讨会发言者名单,客人中有MaxCooper,DennisBurton等免疫学届的名家，也有特地从日本，澳大利亚，欧洲，非洲，夏威夷等地赶来的老朋友：我临时更改了演讲题目，用了“Re...
View Article创业者不要迷信风投
哈佛商业周刊几年前有篇很好的文章，提醒创业者不要迷信风投。文章说出六个人们对风投的常见误解：1）风投是创业者的主要资金来源。2）风投投入初创公司是承担了巨大风险。3）绝大多数风投会给创业者提供重要建议和帮助。4）风投会有超常的回报。5）风投基金越大越好。6）风投是创新者。这篇文章并不详尽，但是这类的“反面”意见不多，所以值得大家关注。太多的创业者把风投看成公司发展的必然阶段，也不全面。我自己的创业经...
View Article“那个美女CEO的血液诊断公司怎么了？”
这几天，在华尔街报带领下，各大媒体一窝蜂地爆料Theranos公司负面新闻，简单Google一下就可以看到：故事的主线是：平时爱穿黑色套头羊毛衫的美女CEO，十九岁从斯坦福退学成了Theranos公司，因为从小就怕针，发誓开发出一个仪器，只用一滴指尖血就能血诊断成百上千个指标，给医疗行业带来革命性的革新，改变世界，造福人类。结果华尔街报的记者侦探发现该公司的诊断数据非常不准，而且绝大多数试验都不是用...
View Article新年，从头说起
前年的元旦，我写了一篇很受欢迎的有关理发的博文，今年元旦我们还是“从头谈起”，讲跟头发有关的内容，聊聊分头的方向。从一个广播节目中听到一个有趣的理论，叫做“TheHairparttheory",还专门有一个博客讨论这个问题，这个理论是John和CatherineWalter兄妹两人提出的。这个“理论”认为人的发型往那边分很重要：男的从左往右分的比较常见，这种发型的人受人爱戴...
View Article去台湾，当中国人。
我太太是台湾本省人，我们在美国UAB（UniversityofAlabamaatBirmingham)留学的时候认识，我读医学遗传系博士，她读神经科学博士，都要修CMB课程（CellandMolecularBiology)。校园里我们是第二对台湾大陆留学生结婚的。八十年代末，两岸关系还很紧张，双方的家长都很着急，她父亲说什么都不答应把最贴心的小女儿嫁给"共匪&...
View Article施一公和方舟子说的我都不懂
我压根不懂量子纠缠，所以施一公讲的我不懂；方舟子水平太高，所以他说的我不懂是必然的。施一公搞了一辈子科研，最后还是觉得力不从心，许多事情没法解释，于是认为生命奥秘不可知的原因可能是我们的理论框架有问题：物理学早就到了量子水平，我们还在跟牛一起顿着。不知道为什么，我觉得施一公的《生命科学认知的极限》有点像瞿秋白的《多余的话》，干了一辈子的“革命”，累了，跟自己说些贴心的话，不巧让全世界听到了。没有把 ...
View Article5名华人科学家涉嫌盗窃GSK商业机密
华尔街报等各大报刊都对这个事件有报道：这让我想起两年前的一篇博客：FBI逮捕华人科学家。美国政府是否在有计划，有目的的监视华裔科学家？不断有华人科学家因涉嫌盗取商业科技情报被调查，是华盛顿过于敏感？还是华人科学家做过头了？在海外顶端高科技企业中，华人科学家掌握敏感技术的人大有人在，这些人是否都该小心了？那些“出问题”的科学家是为国家？还是为自己？如果按冷战时代的思维，人们就会说这些事件不是偶发的个案...
View Article肿瘤免疫疗法：战略对头，战术乏力。
肿瘤治疗，在短短几十年间经历了手术，放疗，化疗，靶向疗法，到免疫疗法的几个发展阶段，现在最红火的当然是免疫疗法。免疫疗法又大致分成细胞疗法，和PD－1等抑制剂的方法。说白了，细胞疗法就是从病人身上（也有从正常人身上）召集能对抗肿瘤的“战士”（免疫细胞），然后送他们到军校培训（体外培养），培训的主要目的是识别敌人（把免疫细胞暴露给肿瘤特异性抗原），然后把训练好的士兵送到战场歼敌（肿瘤）。这个战略看上去...
View Article科研创新犹如做“空头”？
上周末和太太去看了一个新电影，TheBigShort,《大空头》:电影的演员，导演阵容强大，已经有好几项奥斯卡奖提名了。卖座率也很可观。电影讲的是08年美国经济危机以前，几位有眼光的投资人看到美国房贷市场的泡沫，提前做空，最后获利的故事。很可贵的是电影吧经济危机的原因，经过，用有趣易懂的方式解释给观众，既是娱乐，又涨知识。空头的定义：交易人预料货价将跌而卖出期货，伺机买进相抵，这种人叫空头，他们先卖...
View Article疾病可以诊断，健康如何评估？
大家都希望有一个健康的身体，可是到底什么是健康？你是否健康？能否用一个客观准确的实验检测一下健康水平？我认为健康的“临床表现”可以用以下几点来描述：（1）健康者没有病；（2）健康者少得病；（3）健康者得病很快就好；（4）健康者长寿。我想，对上面这些描述大家不会有什么异议。不过，再仔细看看上面对健康的描述，你就会发现所有四点对健康的描述实际上都是以疾病为参照物的。（1）是说“我现在没病”；（2）是说“...
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